数据科学理学硕士的学生需要修满30学分方可毕业，课程旨在全面覆盖数据科学生态系统的所有主要组成部分，有5门核心课程和1门可选修的顶点项目，选修课程大致分为三类，即基础课程、探索课程、应用领域课程。基础课程提供学生在没有足够背景知识的情况下可能需要修读的课程；探索课程提供一整套课程，允许学生深入探索与数据科学相关的各种数据驱动技术和问题；应用领域课程有一门不受限制的选修课程，专注于感兴趣的特定应用领域，为学生提供其顶点项目的目标应用领域的必要背景。顶点项目将为学生提供在工业环境或学术界实现特定领域应用的数据科学生态系统的机会，项目可以是团队或个人，可以在工业环境中进行（即在南洋理工大学以外但在新加坡的行业中进行），也可以在南洋理工大学内部的学术/联合实验室中进行（例如，南洋理工大学公司实验室），前者使学生能够解决行业特定的数据科学问题，而后者使学生有机会为非工业最终用户解决此类问题。除衔接课程外，每门课程均为3学分课程，共39学时，包括讲座、辅导课、范例课和实验，为期13周，顶点项目是一个为期一年的6学分项目。衔接课程（Python编程）为0学分，面向本科毕业编程经验有限的学生和通常不写代码的在职成年人，所有学生都可以在第一学期上衔接课程，这不是必修课。